Ka shumë mosmarrëveshje rreth aftësive intelektuale të qenve. Por mendja e qenit nuk është studiuar ende mjaftueshëm për të shpjeguar me justifikim disa momente të sjelljes së tyre. Gjatë studimeve dhe vrojtimeve të ndryshme, u zbulua se cilat lloje të qenve janë më inteligjente, se si qentë reagojnë ndaj situatave të ndryshme, si zhvillojnë reflekset ndaj stimujve. Por vlen të merret parasysh se vlerësimi i qenve më inteligjent varet nga kriteret me të cilat përcaktohen aftësitë e tyre. Për shembull, nëse kriteri kryesor është aftësia për të mësuar, atëherë qentë kryesorë të mençur drejtohen nga kolli kufitare, të cilat janë të lehta për tu trajnuar. Dogs breed Border Collie në gjendje të punojnë si si një qen të sigurisë dhe si një dado. Vendi i dytë në këtë listë merret nga një qen qimedredhur, e ndjekur nga një bari gjerman. Në të njëjtën kohë, një lloj i tillë i zgjuar i qenve si Chow Chow zë vetëm vendin e 75, pavarësisht faktit se këta qen kanë aftësi intelektuale shumë të zhvilluara. Një pozicion i ulët në vlerësim është për shkak të faktit se chow nuk do të ekzekutojë ekipin nëse nuk e sheh të nevojshme. E njëjta gjë vlen edhe për Barinjtë Kaukazianë, kur trajnimi i disa ekipeve as nuk punon. Për shembull, Bariu Kaukazian nuk do ta mbrojë masterin në stërvitje nga një sulmues i vijës së parë. Ajo e kupton plotësisht se nuk ka asnjë kërcënim, por nëse ajo arrin ta tejkalojë atë dhe beson se sulmi është real, atëherë sulmuesi do të jetë në rrezik të madh, meqë qeni sillet në mënyrë të paparashikueshme në situata të tilla. E njëjta gjë vlen edhe për Laikas. Ata veprojnë në bazë të situatës dhe mund të jenë të pabindur. Kjo sjellje nuk tregon një nivel të ulët të inteligjencës. Për një kohë të gjatë, huskies ishin shokët e njeriut në kushtet e vështira të veriut. Njerëzit duhej të mbështeteshin kryesisht në dhunti, erë dhe dëgjim të qenve të tyre, për shembull, qentë në parzmore mund të ndalonin ose të merrnin zotërin absolutisht në drejtimin tjetër nëse ndjenin rrezik, për shembull, çarje në akull. Kështu, ata kanë formuar një kuptim të caktuar të marrëdhënies me njeriun, paraqitja e verbër nuk është e natyrshme në këtë race, dhe megjithatë aftësia e tyre për të marrë vendimet e tyre dhe për të vepruar siç kërkohet në një situatë të veçantë, është tregues i aftësive shumë të larta intelektuale.
Çdo lloj qeni u edukua ose zbutet nga njeriu për qëllime specifike, prandaj është e vështirë të përcaktohet se cila race është më inteligjente. Për shembull, edhe qeni më inteligjent, i dedikuar për mbrojtje, nuk mund të jetë i dobishëm në gjueti, dhe shoqëruesi i qenve, i cili e kupton zotin e tij nga gjysma e fjalës, njeh mjaft ekipe, nuk mund të mblidhet ose të ruajë siç duhet territorin. Kjo është arsyeja pse është e pamundur të përcaktohet raca më inteligjente e qenve. Është gjithashtu e pamundur të përcaktohet se kush është më i mençur se një mace apo një qen. Cats krejtësisht të ndryshme përshtaten në mjedis, mendojnë ndryshe dhe perceptojnë informacion. Për më tepër, macja nuk do të bëjë asgjë në kundërshtim me dëshirën e saj, edhe nëse kupton atë që kërkohet prej tij. Një qen i zgjuar gjithashtu nuk mund të kryejë komandat që ai nuk e konsideron të përshtatshme, por ende sjelljen dhe qëndrimin e tij
Përveç aftësive të natyrshme në një race të caktuar, shumë varet nga arsimi dhe trashëgimia. Edhe qeni më inteligjent, nëse edukohet në mënyrë të parregullt, mund të humbasë cilësitë e tij. Për shembull, një piktori Labrador konsiderohet të jetë një qen i balancuar dhe lehtësisht i trajnuar, i cili përdoret si një qen udhëzues për shërbimin e shpëtimit dhe të policisë. Me një listë të tillë përparësish, Labradorët zënë një nga vendet e para në statistikat e sulmeve ndaj njerëzve. Ky paradoks shpjegohet me faktin se duke shpresuar për cilësinë e racave, pronarët nuk i kushtonin vëmendje të duhur edukimit, gjë që rezultoi në mosbindje dhe agresion. Nëse para blerjes së kone, pronarët e ardhshëm do të dinë saktësisht se cilat cilësi duhet të kenë kafshët e tyre, sa kohë mund të japin për trajnim, çfarë edukimi dhe infermieri janë të nevojshme për qen, atëherë ata do të jenë në gjendje të zgjedhin racën e duhur dhe të rritin një qen shumë inteligjent.